Counter-Strike 1.6 Minecraft представляет собой версию Counter-Strike, оформленную в стиле знаменитой игры Minecraft, с рядом изменений: перчатки оформлены в стиле Minecraft, нож заменён на кирку, а гранаты — на блоки TNT, модели спецназа и террористов выполнены в квадратном формате, фон украшен персонажами Counter-Strike, стилизованными под Minecraft, и добавлен улучшенный конфиг.

Также были обновлены: HUD, музыкальное сопровождение в меню, и иконка запуска, а все карты взяты из мира Minecraft.

Игра Counter-Strike 1.6 Minecraft включает все функции оригинала: совместима со всеми версиями Windows, позволяет играть онлайн на более чем 1000 серверах, а также с ботами на любых картах, использовать русские никнеймы и чат, а также поддерживает установку любых модификаций.